Méthodes multiblocs pour l'identification de gènes associés au vieillissement cutané - E3S - Supélec Sciences des Systèmes Accéder directement au contenu
Communication Dans Un Congrès Année : 2012

Méthodes multiblocs pour l'identification de gènes associés au vieillissement cutané

Résumé

A study was conducted on 502 women to identify genes affecting skin aging. General and phenotypic data were collected and a blood sample was taken for genetic analysis. The severity of photoaging and 12 signs of skin aging were evaluated from digital photographs of the face with photographic ordinal scales. Three scores were then calculated from these signs of aging. Genotyped SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) allowed identifying 15.198 genes for each of the 502 women. The analysis of the relationship between these genes, photoaging and the scores was performed using a multiblock method associated with a resampling method (bootstrap) to select significative SNPs within each bloc. Blocks of genes containing the number of allelic mutations by SNPs are the independent variables, and scores and photoaging are the variables to be explained.
Une étude a été conduite sur 502 femmes afin d'identifier des gènes ayant un impact sur le vieillissement cutané. Des données générales et phénotypiques ont été recueillies ainsi qu'un échantillon de sang pour les analyses génétiques. La sévérité du photovieillissement et de 12 signes de vieillissement cutané ont été appréciés à partir de photographies numériques du visage grâce à des échelles photographiques ordinales. Trois scores ont ensuite été calculés à partir de ces signes de vieillissement. Les SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) génotypés ont permis de répertorier 15198 gènes pour chacune des 502 femmes. L'analyse des liens entre ces gènes, les scores et le photovieillissement a été réalisée à l'aide d'une méthode multiblocs associée à une méthode de rééchantillonnage (bootstrap) afin de sélectionner les SNPs les plus significatifs au sein de chaque bloc. Les blocs de gènes contenant le nombre de mutations alléliques par SNPs sont les variables explicatives, et les scores et le photovieillissement sont les variables à expliquer.
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Dates et versions

hal-00752243 , version 1 (25-03-2020)

Identifiants

  • HAL Id : hal-00752243 , version 1

Citer

Anne Bernard, Arthur Tenenhaus, Jean-François Zagury, Christiane Guinot, Gilbert Saporta. Méthodes multiblocs pour l'identification de gènes associés au vieillissement cutané. JdS'12, May 2012, Bruxelles, Belgique. ⟨hal-00752243⟩
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