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Bienvenue sur la collection MicroScope, vous y trouverez les publications scientifiques qui ont utilisé la plate-forme MicroScope

MicroScope membre des infrastructures IFB et France Génomique est la plate-forme d'annotation et d'analyse du génome microbien du LABGeM - CEA/Genoscope sous la tutelle CEA, CNRS et Université Evry Val de Seine

Les différentes activités de la plate-forme MicroScope sont : L'innovation de génomes microbiens (génomes et métagénomes assemblés) et développement d'outils destinés à l'annotation, à la génomique et au métabolisme comparatifs de génomes bactériens; la génomique comparative et pangénomique; la prédiction de fonction et de processus biologiques; la reconstruction de réseaux métaboliques; l'analyse de données de transcriptonique; l'assistance techniques; la formation à l'annotation de génomes procaryotes et à la curation de réseaux métaboliques.

COLLABORATION INTERNATIONALE

 

 Pour toute question : hal@cea.fr

 

NOMBRE DE TEXTES INTEGRAUX

222

NOMBRE DE NOTICES

72

INDICATEUR D'OPEN ACCESS

87 %

MOTS CLES

Oxidative stress ACL Genome evolution Secondary metabolites HGT Adaptation Pathogenicity Dehalogenation Holobiont Thermophile Proteomics Genome Insect Dichloromethane Genomics Bacteroidetes Acid mine drainage AMD Metagenomics Acinetobacter baumannii Formate assimilation Food Heavy metal resistance Lactic acid bacteria Average nucleotide identity Experimental evolution Bacteriocin Pangenome Nitrification Microbial genomics Iron uptake Genome-scale metabolic networks Genome mining Microbiology Cyanobacteria Actinorhizal symbiosis Lactobacillus Clostridioides difficile Transcriptome Bacteria Comparative genomics Fish pathogen Mobile genetic elements Bacterial genetics Fish pathogens Continuous culture Activated sludge Magnetotactic bacteria Mineral weathering Aquaculture Virulence factors Alkaline thermal spring ESBL Magnetotaxis Fitness cost Agrobacterium tumefaciens Bactérie Metabolic networks Functional annotation Flavobacteriaceae Genomes Rhizobium Legume-rhizobium symbiosis CTX-M-15 Escherichia coli Evolution Horizontal gene transfer Biofilm Transcriptomics Virulence Gut microbiota Archaea Arsenic Biodiversity Marine bacteria Hydrothermal Bioremediation Metabolomics Natural products Complete genome Bacterial Flavobacterium psychrophilum Polyphasic taxonomy Symbiosis Gene regulation Nitrogen fixing Anaerobic Brochothrix thermosphacta Genome sequence Molecular evolution Digital DNA-DNA hybridization DDDH Fish-pathogenic bacteria Phylogeny Bacteriophage Directed evolution Nitrogen fixation Metabolism Betaproteobacteria Functional genomics Coevolution