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A case-only study to identify genetic modifiers of breast cancer risk for BRCA1/BRCA2 mutation carriers

Juliette Coignard 1, 2, 3, 4 Michael Lush Jonathan Beesley Tracy O'Mara Joe Dennis Jonathan Tyrer Daniel Barnes Lesley Mcguffog Goska Leslie Manjeet Bolla Muriel Adank Simona Agata Thomas Ahearn Kristiina Aittomäki Irene Andrulis Hoda Anton-Culver Volker Arndt Norbert Arnold Kristan Aronson Banu Arun Annelie Augustinsson Jacopo Azzollini Daniel Barrowdale Caroline Baynes Heiko Becher Marina Bermisheva Leslie Bernstein Katarzyna Białkowska Carl Blomqvist Stig Bojesen Bernardo Bonanni Ake Borg Hiltrud Brauch Hermann Brenner Barbara Burwinkel Saundra Buys Trinidad Caldés Maria Caligo Daniele Campa Brian Carter Jose Castelao Jenny Chang-Claude Stephen Chanock Wendy Chung Kathleen Claes Christine Clarke J Margriet Collée Don Conroy Kamila Czene Mary Daly Peter Devilee Orland Diez Yuan Chun Ding Susan Domchek Thilo Dörk Isabel Dos-Santos-Silva Alison Dunning Miriam Dwek Diana Eccles a Heather Eliassen Christoph Engel Mikael Eriksson D Gareth Evans Peter Fasching Henrik Flyger Florentia Fostira Eitan Friedman Lin Fritschi Debra Frost Manuela Gago-Dominguez Susan Gapstur Judy Garber Vanesa Garcia-Barberan Montserrat García-Closas José García-Sáenz Mia Gaudet Simon Gayther Andrea Gehrig Vassilios Georgoulias Graham Giles Andrew Godwin Mark Goldberg David Goldgar Anna González-Neira Mark Greene Pascal Guénel 4, 5 Lothar Haeberle Eric Hahnen Christopher Haiman Niclas Håkansson Per Hall Ute Hamann Patricia Harrington Steven Hart Wei He Frans Hogervorst Antoinette Hollestelle John Hopper Darling Horcasitas Peter Hulick David Hunter Evgeny Imyanitov Agnes Jager Anna Jakubowska Paul James Uffe Birk Jensen Esther John Michael Jones Rudolf Kaaks Pooja Middha Kapoor Beth Karlan Renske Keeman Elza Khusnutdinova Johanna Kiiski Yon-Dschun Ko Veli-Matti Kosma Peter Kraft Allison Kurian Yael Laitman Diether Lambrechts Loic Le Marchand Jenny Lester Fabienne Lesueur Tricia Lindstrom Adria Lopez-Fernández Jennifer Loud Craig Luccarini Arto Mannermaa Siranoush Manoukian Sara Margolin John Martens Noura Mebirouk Alfons Meindl Austin Miller Roger Milne Marco Montagna Katherine Nathanson Susan Neuhausen Heli Nevanlinna Finn Nielsen Katie O'Brien Olufunmilayo Olopade Janet Olson Håkan Olsson Ana Osorio Laura Ottini Tjoung-Won Park-Simon Michael Parsons Inge Sokilde Pedersen Beth Peshkin Paolo Peterlongo Julian Peto Paul Pharoah Kelly-Anne Phillips Eric Polley Bruce Poppe Nadege Presneau Miquel Angel Pujana Kevin Punie Paolo Radice Johanna Rantala Muhammad Rashid Gad Rennert Hedy Rennert Mark Robson Atocha Romero Maria Rossing Emmanouil Saloustros Dale Sandler Regina Santella Maren Scheuner Marjanka Schmidt Gunnar Schmidt Christopher Scott Priyanka Sharma Penny Soucy Melissa Southey John Spinelli Zoe Steinsnyder Jennifer Stone Dominique Stoppa-Lyonnet 2, 6, 7 Anthony Swerdlow Rulla Tamimi William Tapper Jack Taylor Mary Beth Terry Alex Teulé Darcy Thull Marc Tischkowitz Amanda Toland Diana Torres Alison Trainer Thérèse Truong Nadine Tung Celine Vachon Ana Vega Joseph Vijai Qin Wang Barbara Wappenschmidt Clarice Weinberg Jeffrey Weitzel Camilla Wendt Alicja Wolk Siddhartha Yadav Xiaohong Yang Drakoulis Yannoukakos Wei Zheng Argyrios Ziogas Kristin Zorn Sue Park Mads Thomassen Kenneth Offit Rita Schmutzler Fergus Couch Jacques Simard Georgia Chenevix-Trench Douglas Easton Nadine Andrieu 1, 2, 3, * Antonis Antoniou Tracy O’mara Ophélie Bertrand Sandrine Caputo Anaïs Dupré Marine Le Mentec Muriel Belotti Anne-Marie Birot Bruno Buecher Emmanuelle Fourme Marion Gauthier-Villars Lisa Golmard Claude Houdayer Virginie Moncoutier Antoine de Pauw Claire Saule Olga Sinilnikova Sylvie Mazoyer Francesca Damiola Laure Barjhoux Carole Verny-Pierre Mélanie Léone Nadia Boutry-Kryza Alain Calender Sophie Giraud Olivier Caron Marine Guillaud-Bataille Brigitte Bressac-De-Paillerets Yves- Jean Bignon Nancy Uhrhammer Christine Lasset Valérie Bonadona Pascaline Berthet Dominique Vaur Laurent Castera Tetsuro Noguchi Cornel Popovici Hagay Sobol Violaine Bourdon Audrey Remenieras Catherine Noguès Isabelle Coupier Pascal Pujol Aurélie Dumont Françoise Révillion Claude Adenis Danièle Muller Emmanuelle Barouk-Simonet Françoise Bonnet Virginie Bubien Nicolas Sevenet Michel Longy Christine Toulas Rosine Guimbaud Laurence Gladieff Viviane Feillel Dominique Leroux Hélène Dreyfus Christine Rebischung Magalie Peysselon Fanny Coron Laurence Faivre Amandine Baurand Caroline Jacquot Geoffrey Bertolone Sarab Lizard Fabienne Prieur Marine Lebrun Caroline Kientz Sandra Fert Ferrer Véronique Mari Laurence Vénat-Bouvet Capucine Delnatte Stéphane Bézieau Isabelle Mortemousque Florence Coulet Chrystelle Colas Florent Soubrier Mathilde Warcoin Johanna Sokolowska Myriam Bronner Marie-Agnès Collonge-Rame Alexandre Damette Paul Gesta Hakima Lallaoui Jean Chiesa Denise Molina-Gomes Olivier Ingster Helen Gregory Zosia Miedzybrodzka Patrick Morrison Kai-Ren Ong Alan Donaldson Mark Rogers M. 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Wijnands Judith de Lange Dinny Graham Mythily Sachchithananthan Deborah Marsh Rodney Scott Robert Baxter Desmond Yip Jane Carpenter Alison Davis Nirmala Pathmanathan Peter Simpson 
Abstract : Breast cancer (BC) risk for BRCA1 and BRCA2 mutation carriers varies by genetic and familial factors. About 50 common variants have been shown to modify BC risk for mutation carriers. All but three, were identified in general population studies. Other mutation carrier-specific susceptibility variants may exist but studies of mutation carriers have so far been underpowered. We conduct a novel case-only genome-wide association study comparing genotype frequencies between 60,212 general population BC cases and 13,007 cases with BRCA1 or BRCA2 mutations. We identify robust novel associations for 2 variants with BC for BRCA1 and 3 for BRCA2 mutation carriers, P < 10 −8 , at 5 loci, which are not associated with risk in the general population. They include rs60882887 at 11p11.2 where MADD , SP11 and EIF1 , genes previously implicated in BC biology, are predicted as potential targets. These findings will contribute towards customising BC polygenic risk scores for BRCA1 and BRCA2 mutation carriers.
Document type :
Journal articles
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03660355
Contributor : Amandine Michel-Avella Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Thursday, May 5, 2022 - 5:37:49 PM
Last modification on : Saturday, October 22, 2022 - 5:01:53 AM
Long-term archiving on: : Saturday, August 6, 2022 - 6:45:38 PM

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s41467-020-20496-3.pdf
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Juliette Coignard, Michael Lush, Jonathan Beesley, Tracy O'Mara, Joe Dennis, et al.. A case-only study to identify genetic modifiers of breast cancer risk for BRCA1/BRCA2 mutation carriers. Nature Communications, 2021, 12 (1), pp.1078. ⟨10.1038/s41467-020-20496-3⟩. ⟨hal-03660355⟩

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